Misija Učilišta Magistra je osigurati kvalitetnu obuku i usavršavanje učenika, studenata i polaznika raznih dobnih skupina kako bi stekli znanja, vještine i kompetencije potrebne za uspješno obavljanje poslova u suvremenom poslovnom svijetu. Učilište Magistra nastoji stvoriti dinamično, poticajno i inovativno okruženje za učenje, uz korištenje suvremenih tehnologija i metoda rada.
Učilište Magistra također pruža podršku polaznicima u njihovom daljnjem razvoju kroz savjetovanje, mentorski rad i uspostavljanje kontakata s poslodavcima. Osim toga, Učilište Magistra ima za cilj podržati gospodarski razvoj Hrvatske kroz pružanje obrazovanja i edukacije koja je prilagođena potrebama tržišta rada.
Učilište Magistra teži biti prepoznato kao institucija koja potiče inovativnost, razvija kreativnost i osnažuje polaznike da postanu lideri u svom području rada. Učilište Magistra nastoji održati najviše standarde kvalitete i etike u svim aspektima svog rada, što uključuje akademsku izvrsnost, društvenu odgovornost i poštovanje prema polaznicima, zaposlenicima i široj zajednici.
Učilište Magistra želi biti prepoznato kao vodeće obrazovno središte za stručno osposobljavanje, usavršavanje i edukaciju u Hrvatskoj.